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Las secuencias parciales de SARS-CoV-2 de los primeros brotes en Wuhan fueron eliminadas de una base de datos del gobierno de los Estados Unidos por los cient??ficos que las depositaron, advierte una investigaci??n publicada en la revista cient??fica Nature
Los esfuerzos para estudiar las primeras etapas de la pandemia de coronavirus han recibido ayuda de una fuente sorprendente.??Un bi??logo en los Estados Unidos ha ???excavado??? secuencias parciales del genoma del SARS-CoV-2 desde los inicios del probable epicentro de la pandemia en Wuhan,??China, que fueron depositadas, pero luego eliminadas, de una base de datos del gobierno de los Estados Unidos.
Seg??n una investigaci??n publicada en la revista cient??fica Nature, las secuencias del genoma parcial abordan un enigma evolutivo sobre la diversidad gen??tica temprana del coronavirus SARS-CoV-2, aunque los cient??ficos enfatizan que no arrojan luz sobre sus or??genes. Tampoco est?? del todo claro por qu?? los investigadores de la Universidad de Wuhan pidieron que las secuencias se eliminen del Archivo de Lectura de Secuencias (SRA, por sus siglas en ingles), un repositorio de datos de secuenciaci??n sin procesar que mantiene el Centro Nacional de Informaci??n Biotecnol??gica (NCBI), parte de los Institutos Nacionales de Estados Unidos of Health (NIH).
???Estas secuencias??son informativas, no transformadoras???,??dice??Jesse Bloom,??genetista evolutivo viral del??Centro de Investigaci??n del C??ncer Fred Hutchinson??en Seattle, Washington, quien describe en??un preimpreso??del 22 de junio c??mo recuper?? las secuencias.
Bloom??descubri?? las secuencias despu??s de buscar datos gen??micos de las primeras etapas de la pandemia. Un art??culo de investigaci??n de mayo de 2020 conten??a??una tabla de datos de secuencia disponibles p??blicamente,??que??inclu??a??entradas que Bloom no hab??a encontrado. Las secuencias se asociaron con un art??culo, que aplic?? una tecnolog??a conocida como??secuenciaci??n de nanoporos para detectar material gen??tico del SARS-CoV-2 en muestras de personas.??Ese??estudio??fue publicado en la revista??Small??en junio de 2020.
Cuando Bloom busc?? las secuencias en la SRA utilizando los detalles enumerados en el documento de mayo de 2020, la base de datos no arroj?? entradas. La SRA mantiene las secuencias en el almacenamiento en la nube mantenido por Google, y Bloom se pregunt?? si podr??a encontrar versiones archivadas de las secuencias en servidores en la nube. Este enfoque funcion?? y el experto pudo recuperar datos de 50 muestras, 13 de las cuales conten??an suficientes datos sin procesar para generar secuencias parciales del genoma.
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Las secuencias recuperadas, que probablemente se recopilaron en enero y febrero de 2020, muestran que este es el caso: est??n m??s estrechamente relacionadas con los virus de los murci??lagos que las secuencias de personas vinculadas al mercado de productos del mar (REUTERS)
???Las secuencias ayudan a resolver un misterio evolutivo sobre las primeras etapas de la pandemia???, dice Bloom. Las primeras secuencias virales de Wuhan provienen de individuos vinculados al mercado de mariscos de Huanan de la ciudad en diciembre de 2019, que inicialmente se pens?? que era el lugar donde el coronavirus salt?? por primera vez de los animales a las personas. Pero las secuencias del mercado de mariscos est??n m??s relacionadas con los parientes m??s cercanos del SARS-CoV-2 en los murci??lagos, el origen ??ltimo m??s probable del virus, que las secuencias posteriores, incluida una recolectada en los Estados Unidos.
Eso fue sorprendente, seg??n Bloom, porque cabr??a esperar que los virus de las primeras etapas de la epidemia de Wuhan estuvieran m??s estrechamente relacionados con los parientes del SARS-CoV-2 que infectan a los murci??lagos. Las secuencias recuperadas, que probablemente se recopilaron en enero y febrero de 2020, muestran que este es el caso: est??n m??s estrechamente relacionadas con los virus de los murci??lagos que las secuencias de personas vinculadas al mercado de productos del mar.
Esto se suma a un creciente cuerpo de evidencia, incluidos informes de casos probables que se remontan a noviembre de 2019, de que los primeros casos humanos de COVID-19 no estaban asociados con el mercado de mariscos de Huanan, advierten Bloom y otros cient??ficos.
???A m?? me pareci?? que el mercado de Wuhan fue uno de los primeros eventos de s??per propagaci??n???, explica Sudhir Kumar, un genetista evolutivo de la Universidad de Temple en Filadelfia, Pensilvania. ???Las secuencias que descubri?? Bloom -agrega- sugieren que el SARS-CoV-2 desarroll?? una amplia diversidad en las primeras etapas de la pandemia en China, incluso en Wuhan???.:quality(85)/cloudfront-us-east-1.images.arcpublishing.com/infobae/YOS7GAKDC4TWMC434C3AH72TA4.jpg%20420w)
Esto se suma a un creciente cuerpo de evidencia, incluidos informes de casos probables que se remontan a noviembre de 2019, de que los primeros casos humanos de COVID-19 no estaban asociados con el mercado de mariscos de Huanan (REUTERS)
Stephen Goldstein, vir??logo de la Universidad de Utah en Salt Lake City, se??ala que ???las secuencias que recuper?? Bloom no estaban ocultas: se describen en detalle, con suficiente informaci??n de secuencia para conocer su relaci??n evolutiva con otras secuencias tempranas del SARS-CoV-2, en el peri??dico Small???. ???No creo que esta preimpresi??n nos diga muchas cosas nuevas, pero s?? trae a la vanguardia datos de secuencia que han estado disponibles p??blicamente, aunque bajo el radar???, indica Goldstein.
Bloom??dice que??aunque las secuencias se publicaron, su eliminaci??n de la SRA signific?? que pocos cient??ficos las conoc??an.??Un informe encargado por la??Organizaci??n Mundial de la Salud??sobre los or??genes de la pandemia??no incluy?? las secuencias en un an??lisis evolutivo de los primeros datos del SARS-CoV-2. ???Nadie se dio cuenta de que exist??an???,??subraya.
Los autores correspondientes del art??culo de Small no respondieron a las preguntas del equipo de noticias de Nature sobre por qu?? pidieron que se eliminaran las secuencias de la SRA, lo que sucedi?? antes de que se publicara el art??culo. En un comunicado, el NIH dijo que elimin?? los datos a pedido de los investigadores, quienes dijeron que planeaban enviarlos a otra base de datos.
Bloom,??quien fue coautor de??una carta??en la que ped??a una investigaci??n renovada sobre los or??genes de la pandemia, incluida la posibilidad de que el virus se escapara o se filtrara de un laboratorio, dice que ???su estudio no arroja luz sobre los or??genes de la pandemia ni sobre por qu?? las secuencias fueron eliminadas???.??Pero??espera que sus esfuerzos animen a los investigadores a ???pensar de manera innovadora??? y buscar otras fuentes,??como datos de archivo, para obtener m??s informaci??n de los primeros d??as de la pandemia. ???Probablemente haya m??s datos por ah?????, concluye.
Infobae – EFE
